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Usando python3 com asyncio pra passar pelos problemas do mysql

Details
Written by: Helio Loureiro
Category: Python
Published: December 08, 2020
Hits: 3182

Foto do aerporto GRU no dia em que emigrei do Brasil.

Um dos trabalhos que faço como voluntário é manter alguns serviços "alternativos" na empresa.  Todos baseados em software livre.

Dos que são mantidos temos um mediawiki, um encurtador yourls e um etherpad-lite.   E esse último foi o que precisei mexer pra transferir pra um servidor novo.

Muitas pessoas gostam do etherpad-lite e o usam, mas devo dizer que por trás é um lixo.  Serviço porco.  Ele usa uma só tabela no MySQL/MariaDB com dois campos:

mysql> show tables;
+-----------------+
| Tables_in_paddb |
+-----------------+
| store           |
+-----------------+
1 row in set (0.00 sec)

mysql> desc store;
+-------+--------------+------+-----+---------+-------+
| Field | Type         | Null | Key | Default | Extra |
+-------+--------------+------+-----+---------+-------+
| key   | varchar(100) | NO   | PRI |         |       |
| value | longtext     | YES  |     | NULL    |       |
+-------+--------------+------+-----+---------+-------+
2 rows in set (0.01 sec)

Sério.  2 campos.  E só.  Um é uma chave toscamente preparada pra ser chave primária e o resto... é valor.  Então o uso do DB só cresce, sem chances de uma manutenção decente.

Enquanto o uso do etherpad-lite é um dor nas costelas, o assunto é mais da migração dos dados.  Então continuando o assunto, o nosso DB chegou ao incrível valor de 13 GB.   Daí como faz a migração?  O básico é tirar um dump do DB antigo com mysqldump e carregar usando o comand mysql mesmo.

Algo como isso:

# mysql --host=remote-server.mysql.internal.com --port=1234 --user=sqluser --password=sqlpassword mydb < etherpad-migration-backup.sql

 que pra todos efeitos funciona.  O único problema foi que depois de passar 15 horas carregando o arquivo...

ERROR 2013 (HY000) at line 19057418: Lost connection to MySQL server during query

Dizem que não tem dor maior que a dor do parto.  Tem sim e chama-se carregar um dump de 13 GB por 15 horas e falhar.  Assim.

E o que restou fazer.  Bom... eu sabia a linha onde estava o arquivo, mas já tinham sido 15 horas num arquivo serial, que faz linha por linha.   Então decidi quebrar o dump em vários arquivos menores.  Dei um rápido "wc -l" no dump e vi que tinham exatamente 28993313 linhas.  Então era possível quebrar em 28 arquivos de 1 milhão de linhas cada.  E foi o que fiz.

Assim eu sabia que podia continuar do arquivo 20 em diante.  E depois resolvia como fazer com o que faltava.

# split -l 1000000 -d etherpad-migration-backup.sql etherpad-migration-backup.sql.
# ls -1 pad-migration-backup.sql.??
etherpad-migration-backup.sql.00
etherpad-migration-backup.sql.01
etherpad-migration-backup.sql.02
etherpad-migration-backup.sql.03
etherpad-migration-backup.sql.04
etherpad-migration-backup.sql.05
etherpad-migration-backup.sql.06
etherpad-migration-backup.sql.07
etherpad-migration-backup.sql.08
etherpad-migration-backup.sql.09
etherpad-migration-backup.sql.10
etherpad-migration-backup.sql.11
etherpad-migration-backup.sql.12
etherpad-migration-backup.sql.13
etherpad-migration-backup.sql.14
etherpad-migration-backup.sql.15
etherpad-migration-backup.sql.16
etherpad-migration-backup.sql.17
etherpad-migration-backup.sql.18
etherpad-migration-backup.sql.19
etherpad-migration-backup.sql.20
etherpad-migration-backup.sql.21
etherpad-migration-backup.sql.22
etherpad-migration-backup.sql.23
etherpad-migration-backup.sql.24
etherpad-migration-backup.sql.25
etherpad-migration-backup.sql.26
etherpad-migration-backup.sql.27
etherpad-migration-backup.sql.28
etherpad-migration-backup.sql.29

Com isso eu tive vários arquivos que eu podia subir em paralelo.  E foi o que fiz.  O resultado?  Não só um mas vários erros depois de algumas horas carregando.   Eu queria chorar.  No chuveiro.  Em posição fetal.  Só isso.

O maldito do comando mysql não te permite dar um replay descartando o que já existisse no DB, o que seria uma mão na roda nessas situações.  Então fiz isso com python.  Mas achei que seria lento demais manter serializado.  Então era um bom momento pra testar o asyncio, que usei pouquíssimo até hoje.  E valeu muito a pena.  Esse é o script final:

#! /usr/bin/python3

import sys
import pymysql.cursors
import asyncio

connection = pymysql.connect(host="remote-server.mysql.internal.com",
        port=1234,
        user="sqluser",
        password="sqlpassword",
        db="mydb",
        charset='utf8mb4',
        cursorclass=pymysql.cursors.DictCursor)

cursor = connection.cursor()
sema = asyncio.Semaphore(value=10)

async def commit_line(line):
    await sema.acquire()
    print(line)
    try:
        cursor.execute(line)
        connection.commit()
    except:
        print("Line (", line[:10],") already inserted")
        pass
    sema.release()


with open(sys.argv[1]) as sqlfile:
    loop = asyncio.get_event_loop()
    for line in sqlfile.readlines():
        loop.run_until_complete( commit_line(line) )
    loop.close()

Não está dos mais polidos, e com senha dentro, mas era uma coisa rápida pra resolver meu problema.  E resolveu.

Eu criei uma fila de 10 processos em paralelo pra rodar com: sema = asyncio.Semaphore(value=10)

o controle de acesso ao processo pra rodar é feito com sema.acquire() e sema.release().  Muito fácil.  Nem precisei criar um objeto Queue.

Dentro do loop do commit_line() eu sabugue um "enfia essa linha lá ou então continua".  Simples assim.  E funcionou.

Eu já tinha deixado o tmux aberto com várias janelas, uma pra cada arquivo, então foi só rodar o mesmo em cada uma que falhou.

Levou mais umas 2 ou 3 horas mas carregou tudo.

Foi lindo, não foi?

Script python pra verificar se hosts e portas estão disponíveis

Details
Written by: Helio Loureiro
Category: Python
Published: April 29, 2020
Hits: 5944

Hoje chegou um mail pedindo pra testar uma mudança de máquinas que saíram da empresa pra irem habitar o cloud.  A tarefa era testar máquina e porta.  Algumas máquinas com uma porta somente, outras com várias.  E todas TCP.

Pra fazer isso rapidamente eu escrevi um script em python3 que basicamente estabelece uma conexão TCP e mostra OK se conectar ou FAIL se não conseguir.  Bem básico, mas resolveu meu problema muito mais rápido que se eu fosse testar máquina por máquina, porta por porta provavelmente com o comando telnet.

#! /usr/bin/python3

import socket

servers = [ 
        "helio.loureiro.eng.br:443", 
        "helio.loureiro.eng.br:389", 
        "helio.loureiro.eng.br:8081", 
        "helio.loureiro.eng.br:80", 
        "helio.loureiro.eng.br:22" 
        ]

for server in servers:
    try:
        host, port = server.split(":")
        port = int(port)
        socket.create_connection((host, port), 3)
        print(server, "OK")
    except:
        print(server, "FAIL")

O resultado:

helio.loureiro.eng.br:443 OK
helio.loureiro.eng.br:389 FAIL
helio.loureiro.eng.br:8081 FAIL
helio.loureiro.eng.br:80 OK
helio.loureiro.eng.br:22 OK

Boa diversão!

Artigo sobre raspberrypi e raspresenterpy no churrops on devops

Details
Written by: Helio Loureiro
Category: Python
Published: July 03, 2018
Hits: 5690

Escrevi um artigo pro blog "ChurrOps on DevOps" sobre raspresenterpy aṕos uma conversa sobre o assunto no canal do Telegram do grupo "papo de sysadmin".

 

Eu achava que já tinha escrito sobre isso aqui mesmo, mas fiquei surpreso por não ter encontrado nenhuma referência.

raspresenterpy é um programa de display que alterna links pra ser usado pra mostrar mensagens ou telas de monitoramento como do Jenkins.  Fiz até uma apresentação sobre o mesmo numa PyConSE.  O texto que escrevi detalha sobre repositório e como usar o mesmo.

Ele encontra-se com suporte ao raspbian Jessie e python-qt4.  Testei com python-qt5 e já verifiquei que não funciona.  Então deixei no meu backlog pra corrigir e lançar uma versão mais recente.

https://churrops.io/2018/06/08/usando-python-e-raspberrypi-pra-mostrar-varias-telas/

Monitorando interfaces no Linux via netlink usando Python

Details
Written by: Helio Loureiro
Category: Python
Published: April 22, 2018
Hits: 9606
  • linux
  • python
  • socket
  • monitoramento
  • MAC
  • redes
  • network

Esses dias estava analisando um código que era parecido com shell script.  Sua função era monitorar as interfaces de rede para, no caso de alteração (nova interface surgindo ou desaparecendo), registrar a mudança de objetos no sistema de dados do opensaf (objetos no IMM pra quem conhece).

Mas o código fazia algo parecido com um shell que a todo healthcheck do AMF (framework do opensaf que é muito semelhante ao systemd e roda determinado programa ou script de tempos em tempos) fazia uma busca com o comando "ip link addr list" e comparava com o que estava  armazenado no IMM.  Algo como:

def healthcheckCallback(self, invocation, compName, healthcheckKey):
		        saAmfResponse(self.check_macs,
				      invocation, eSaAisErrorT.SA_AIS_OK)

def check_macs(self):
macs = []
for line in self.get_link_list().split("\n"):
if not re.search("link/ether", line): continue
# [ 'link/ether', '52:54:00:c3:5d:88', 'brd', 'ff:ff:ff:ff:ff:ff']
mac.append(line.split()[1])
imm_obj = self.get_from_imm()
if imm_obj != macs:
self.update_imm(mac)

def get_link_list(self):
linux_command = "ip link list"
return self.run_shell(linux_command)

Essa é uma forma bastante simplificada pra tentar visualizar como tudo funciona.  Eu propositalmente tirei comentários extras e deixei mais limpo apenas para poder comentar aqui. 

  • Agora explicando o que cada método faz ali:
  • healthcheckCallback(): esse é  o método que eu registrei junto ao AMF pra que seja chamado de tempos e tempos e rode a função check_macs().  Não vou entrar em detalhes dos outros parâmetros pois são inerentes em como o AMF funciona junto ao OpenSAF.  Deixei o link pra o exemplo de uma implementação completa ao final do artigo.
  • check_macs(): é uma função que pega uma listagem em formato array do comando "ip link list" e armazena os MAC, endereço de camada 2 da placa de rede.
  • get_link_list(): apenas pra deixar mais legível a parte que busca e monta o array de informações de rede de um sistema Linux.  O método run_shell() é apenas um subprocess.check_output() de forma mais legível (e por isso omiti essa parte do código).

Como a chamada pra buscar os dados junto ao IMM no OpenSAF tem muitas linhas, eu só deixei um get_from_imm() que retornará um array de mac registrados anteriormente.  Se esse valor for diferente do coletado, então é chamado o método update_imm() com os macs que devem estar lá.

Funciona?  Sim, funciona.  Mas... se não houve nenhuma mudança nas interfaces de rede (como a subida de uma interface de VIP ou mesmo um container em docker), por quê eu preciso rodar o get_link_list()? 

Entendeu qual foi meu ponto?

O código em si consiste em rodar o monitoramente separado numa thread.  Toda vez que o código detecta uma mudança (na verdade o kernel sinaliza isso), ele altera uma variável que o programa lê durante o healthcheck.  Algo como:

def check_macs(self):
if self.network_changed is False: return

Assim bem simples.  Teve mudança? network_changed vira um True.

Linux tem mecanismos pra detectar uma mudanças na interfaces de rede.  Por quê não usar?  E foi o que fiz.

Criei um método chamado monitor_link() que é iniciado junto com programa no método initialize(), que é parte de como o AMF faz as chamadas de callback:

self.thread = threading.Thread(target=self.monitor_link, args=())
self.thread.start()

E como funciona o monitor_link()?  Aqui tenho de pedir desculpas antecipadamente que enquanto o código utiliza menos CPU e memória que chamar um shell script, o tamanho e complexidade é bastante grande.  No fim troquei 2 linhas de código por umas 35 linhas.  Na verdade eu praticamente escrevi o código por trás do "ip link".  Mas o resultado ficou independente desse comando e mesmo de utilizar um shell externo pra buscar o resultado.

A primeira coisa é criar um socket do tipo AF_NETLINK.  Em seguida fazer um bind() num ID aleatório e monitorar com RTMGRP_LINK.

def monitor_link(self):
    # Create the netlink socket and bind to RTMGRP_LINK,
    s = socket.socket(socket.AF_NETLINK, socket.SOCK_RAW, socket.NETLINK_ROUTE)
    s.bind((os.getpid(), RTMGRP_LINK))

pra gerar o código aleatório que é um inteiro, usei os.getpid() pra usar o PID do próprio programa.

Em seguida é iniciado um loop com select() em cima do descritor do socket pra leitura.  Quando aparecer algum dado, daí sim a informação é lida.

rlist, wlist, xlist = select.select([s.fileno()], [], [], 1)

O que vem a seguir são quebras da sequência de bits até chegar no ponto é possível ver o tipo de mensagem que chegou do select().  Se o tipo de mensagem for NOOP de algo nulo, apenas continue monitorando no select().  Se vier algum ERROR, pare o programa.  Se vier mensagem e não for do tipo NEWLINK pra um link novo ou mudança de MAC, também continue aguardando no select().

if msg_type == NLMSG_NOOP: continue
elif msg_type == NLMSG_ERROR: break
elif msg_type != RTM_NEWLINK: continue

Por fim uma iteração nos dados pra buscar o tipo.  Se o dado for do tipo IFLA_IFNAME, que é uma nova interface ou mudança de nome, ou IFLA_ADDRESS, que é MAC e endereço IP, muda a flag de network_changed pra True. 

rta_type == IFLA_IFNAME or rta_type == IFLA_ADDRESS:

E é isso.  O código completo segue abaixo.

def monitor_link(self):
    # Create the netlink socket and bind to RTMGRP_LINK,
    s = socket.socket(socket.AF_NETLINK, socket.SOCK_RAW, socket.NETLINK_ROUTE)
    s.bind((os.getpid(), RTMGRP_LINK))

    while self.terminating is False:
        rlist, wlist, xlist = select.select([s.fileno()], [], [], 1)
if self.network_changed is True: continue if self.terminating is True: return
try: data = os.read(rlist[0], 65535) except: continue msg_len, msg_type, flags, seq, pid = struct.unpack("=LHHLL", data[:16]) if msg_type == NLMSG_NOOP: continue elif msg_type == NLMSG_ERROR: break elif msg_type != RTM_NEWLINK: continue data = data[16:] family, _, if_type, index, flags, change = struct.unpack("=BBHiII", data[:16]) remaining = msg_len - 32 data = data[16:] while remaining: rta_len, rta_type = struct.unpack("=HH", data[:4]) if rta_len < 4: break rta_data = data[4:rta_len] increment = (rta_len + 4 - 1) & ~(4 - 1) data = data[increment:] remaining -= increment if rta_type == IFLA_IFNAME or rta_type == IFLA_ADDRESS: self.network_changed = True

Encontrei essa implementação no Stack Overflow buscando informação do código em C.  Foi uma grande ajuda e deixou meu programa muito mais coerente com o que eu realmente queria.

Ficou muito maior?  Ficou.  Mas também ficou muito mais 1337 :)

Mais:

[1] Exemplo de uso de python com AMF no OpenSAF: https://sourceforge.net/p/opensaf/staging/ci/default/tree/python/samples/amf_demo

[2] Projeto OpenSAF: https://sourceforge.net/projects/opensaf/

[3] Implementação original desse código: https://stackoverflow.com/questions/44299342/netlink-interface-listener-in-python

Palestras do FISL no Youtube

Details
Written by: Helio Loureiro
Category: Python
Published: August 29, 2016
Hits: 11710

Estive trabalhando nos últimos tempos em publicar as palestras do FISL no Youtube.  Por que fazer isso?  Bom... primeiramente pra atender um interesse próprio que é assistir os vídeos na minha SmartTV, que é Smart, roda Linux, mas não suporta o formato OGV disponibilizado no site do FISL (software livre é sobre coçar sua coceira, lembram?).  Publicando o conteúdo no Youtube continua OGV por trás, mas daí a TV aceita o format HMTL5 pra envio do stream do vídeo.

Mas isso não é tudo.  Publicando no Youtube um público que não sabe da existência do FISL vai ter acesso aos vídeos.  Tenho notado vários acessos de gente no exterior ao conteúdo em inglês.

E tudo é feito de forma automatizada.  Como cada FISL usou uma forma distinta de publicação, tenho usando um mesmo script modificado a cada edição do evento.  Eles estão armazenados na minha conta de Github.

https://github.com/helioloureiro/homemadescripts

No momento estão carregados os vídeos da última e penúltima edição do FISL, mas pretendo carregar o máximo possível dos eventos anteriores.  

O outro motivo, além da disponibilização dos vídeos em outra plataforma (mesmo não sendo software livre), é ter um acesso permanente aos vídeos.  No momento estão hospedados nas máquinas da ASL assim como um dia tivemos nossas listas de mails nos servidores da CIPSGA (Comitê de Incentivo à Produção de Software Gratuito e Alternativo).  Não sei se a ASL está no mesmo nível da CIPSGA, que usava máquinas na SERPRO se não estou enganado, e por uma falha de disco perderam todos os dados, mas por precaução melhor fazer a maior quantidade de cópias possíveis dos vídeos.

Essa é a idéia no momento.

Nota: eu vi que alguns vídeos estão sem alguns caractéres.  É alguma conversão de utf-8 que deu errado :(

  1. Weather snapshot em Python
  2. Utilizando Python pra postar mensagens com fotos no Twitter
  3. Criando um programa em python com debug
  4. Apresentando Jenkins no display com raspberrypi

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