Depois de quase 3 dias fora do ar (ou intermitente), eis que o site volta ao ar.
Nada como férias pra tentar coisas arriscadas, como um upgrade do Joomla. E não saiu como esperado. E claro que o backup via Akeeba não deu certo.
Então nada melhor que arregaçar as mangas, pegar um café (ou cerveja) e fazer a instalação e migração na mão. Algumas coisas ainda estão meio que quebradas, mas aparentemente o grosso do site foi migrado corretamente. De Joomla 2.5 pro último release de 3.
Mas a luta continua! Algumas coisas ainda apresentam erros de edição e mesmo o template ainda faltam as imagens.